O Ensino Médio é a etapa final da Educação Básica. Essa etapa tem como objetivos:
a consolidação e aprofundamento dos conhecimentos, em que o Colégio passa a assumir o papel de processar o saber, de acordo com o seu significado, de modo que, a partir da sociedade de informação, se possa construir uma sociedade de conhecimento;
a preparação para o mercado de trabalho e a cidadania do educando , para continuar aprendendo, de modo a ser capaz de se adaptar com flexibilidade às novas condições de ocupação e aperfeiçoamento posteriores, interagindo com a realidade e forjando seu espaço histórico,partindo das condições dadas;
aprimoramento do educando como pessoa humana, incluindo a formação ética e o desenvolvimento da autonomia intelectual e do pensamento crítico;
a formação de seres humanos comprometidos com sua comunidade num espírito crítico, solidário e fraterno.
O Ensino Médio valoriza ainda a pesquisa, tanto nos laboratórios próprios como nas atividades de campo com os alunos. Dessa forma, também os valores, como solidariedade, pensamento autônomo, conhecimento sócio-cultural, a interação com a ciência e tecnologia estão contemplados neste nível de ensino.
